Oberstes Gremium des Vienna Wiesenthal Institute (VWI) ist die Generalversammlung. Sie tritt im Regelfall einmal pro Jahr zusammen und trifft alle weitreichenden, strukturellen Entscheidungen, darunter Anpassungen der Organisationsstruktur, Genehmigung und Kontrolle des Budgets, Bestellung der Mitglieder des Vorstandes und des Internationalen Wissenschaftlichen Beirats sowie der Rechnungsprüfer:innen. In der Generalversammlung sind zurzeit vertreten:

Brigitte Bailer (Dokumentationsarchiv des österreichischen Widerstandes)
Julane Bredtmann (International Holocaust Remembrance Alliance, IHRA)
Ulrich Hörmann (OeAD ERINNERN:AT)
Joanna Nittenberg (Bund Jüdischer Verfolgter des Naziregimes)
Bertrand Perz (Universität Wien – Institut für Zeitgeschichte)
Claudia Prutscher (Israelitische Kultusgemeinde Wien)
Margit Reiter (Universität Salzburg – Fachbereich Geschichte)
Barbara Staudinger (Jüdisches Museum Wien)